Према принципу раздвајања молекуларне дестилације, одвајање молекуларне дестилације углавном се ослања на разлику у средњем слободном молекуларном путу између лаких и тешких молекула. У исто време, молекули светлости који се одвајају и који излазе током процеса раздвајања могу се лако добити хлађењем. Лагано рециклирање, тако да технологија молекуларне дестилације има следеће основне карактеристике:
(1) Криогена дестилација далеко од тачке кључања. Конвенционална технологија дестилације углавном се ослања на разлику тачака кључања између једињења за одвајање. Због тога, да би се постигло ефикасно одвајање, једињење које треба да се одвоји мора бити у стању кључања. Стога поступак одвајања конвенционалне технологије дестилације мора бити релативно висок. Висока температура. Технологија раздвајања молекуларне дестилације ослања се на разлику средњег слободног пута молекуларног кретања једињења. Процес дестилације високим вакуумом може не само смањити пуну тачку једињења, већ и повећати разлику у средњем слободном путу између једињења, тако да процес дестилације може бити ефикасна дестилација на ниској температури.
(2) Дестилација под ултра-ниским притиском. Теоретски процес раздвајања молекуларне дестилације одвија се између 0,01Па и 0,1Па. Ултра-ниски притисак дестилације може повећати средњи слободни пут молекуларног кретања једињења, повећавајући тако разлику у средњем слободном путу између једињења, да би се постигло ефикасно одвајање. Традиционална технологија дестилације углавном је дестилација у лонцима. Једињење које се одваја прво испари у гас до тачке кључања. Гасовито једињење се под дејством вакуумске пумпе испумпава у целину и може да се кондензује током протока кроз кондензатор. Размак између кондензатора и површине за испаравање је предуг, због чега овај део
Удаљеност између гасова је пуна гасова, па је тешко смањити притисак на нивоу течности за испаравање. За технологију молекуларне дестилације, јер су кондензатор и површина за испаравање постављени веома уско, када се једињење које се одвоји испари и испусти, одмах се кондензује. Стога је парцијални притисак гасовитих једињења између кондензатора и површине испаривача врло низак. Одвајање једињења при ниском притиску.
(3) Брзо и ефикасно одвајање. У процесу молекуларне дестилације, једињење које се одваја тече из горњег дела тела сепаратора и излази из доњег дела. На површини испаривача, једињење које ће се одвојити формираће течни филм дебљине око 2 мм под дејством дела који чини филм. Течна филм-дестилација погодује ефикасном избацивању једињења које се одваја. Истовремено, у процесу одвајања молекуларне дестилације, кондензациона површина и површина испаравања су постављени близу један другом, тако да једињење које се одваја може брзо да се кондензује једном када истекне, чиме се смањује време задржавања топлоте - осетљиво једињење које се одваја на високој температури, што погодује задржавању карактеристика једињења. Уопште, технологија молекуларне дестилације не може само смањити време задржавања једињења које се одваја на грејној површини, већ и скратити време стајања гасова високе температуре између излаза хлапљивих састојака и кондензације.